Według słów Negroponte, Al-Kaida ma swoje zaplecze na granicy Pakistanu i Afganistanu. Jego zdaniem, dojdzie do kolejnych zamachów z użyciem tradycyjnych rodzajów broni. - Jednak Al-Kaida dąży do tego, by zdobyć broń chemiczną, biologiczną i atomową w celu zaatakowania Stanów Zjednoczonych i amerykańskich interesów na całym świecie - stwierdził szef amerykańskiego wywiadu.
John Negroponte odniósł się też do sprawy irańskiego programu nuklearnego. Jego zdaniem, Teheran najprawdopodobniej nie posiada jeszcze broni atomowej ani materiału rozszczepialnego do jej produkcji.