Baszir spędził za kratkami 26 miesięcy. Sąd uznał, że mężczyzna jest zamieszany w zamachy na indonezyjskiej wyspie Bali, które kosztowały życie 202 osób, głównie zachodnich turystów.
USA i Australia krytykowały Indonezję za wymierzenie Baszirowi zbyt łagodnej - ich zdaniem - kary. Na Bali śmierć poniosło wielu australijskich turystów.
Zachód zarzucał mu ponadto kierowanie powiązaną z Al-Kaidą organizacją terrorystyczną Dżimah Islamija. Baszir nigdy nie przyznał się do winy i zaprzecza, jakoby Dżimah Islamija w ogóle istniała.
